يستخدم منظار المعده فى علاج وتشخيص التهاب المريء ، قرحه المعده أو الاثني عشر ، سرطان المعده ، آلام البطن، أورام المريء، استمرار فقر الدم غير المبرر، حقن وربط دوالي المرئ ، الكي بالأرجون، صعوبة بلع الطعام ، تركيب دعامات المرئ والمعده لتوسيع الضيق الحميد والخبيث تركيب الكلبسات.